Στις 17 Σεπτεμβρίου 2011 εγκαινιάστηκε στο Αρχαιολογικό Μουσείο Θεσσαλονίκης η έκθεση «Οι Εβραίοι Στη Θεσσαλονίκη. Ανεξίτηλα Σημάδια Στον Χώρο».   Η έκθεση επιχειρεί να ανασυνθέσει το παλίμψηστο της μεγαλύτερης εβραϊκής κοινότητας της Ελλάδας, με οδηγούς τα απτά ή λανθάνοντα «ανεξίτηλα σημάδια» της πολύχρονης εβραϊκής παρουσίας στην πόλη. Εκτός από την 9η Εφορεία Βυζαντινών Αρχαιοτήτων, το Μουσείο Βυζαντινού Πολιτισμού, το Λαογραφικό και Εθνολογικό Μουσείο Μακεδονίας-Θράκης, το Εβραϊκό Μουσείο, την Ισραηλιτική Κοινότητα Θεσσαλονίκης, το Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα και το Κέντρο Ιστορίας του Δήμου Θεσσαλονίκης, για την έκθεση αυτή συνεργάστηκε και το ΕΜΕ με την επιλογή και αποστολή 72 σχετικών φωτογραφιών από το Φωτογραφικό του Αρχείο. Η έκθεση διήρκεσε μέχρι 30 Σεπτεμβρίου 2012.