Ακολουθούν η αίθουσα περιοδικών εκθέσεων του Μουσείου και η Αίθουσα Τέχνης Μπενρουμπή, ενώ στο τελευταίο επίπεδο βρίσκεται η πλούσια βιβλιοθήκη και το αναγνωστήριο που είναι προσβάσιμα από το κοινό κατόπιν συνεννόησης.
Λιγότερα από το ένα τρίτο των αποκτημάτων του Μουσείου βρίσκονται στις προθήκες.
Τα υπόλοιπα φυλάσσονται σε αποθηκευτικούς χώρους εξοπλισμένους με την τελευταία λέξη της τεχνολογίας.
Οι περιοδικές εκθέσεις του Μουσείου στόχο έχουν να παρουσιάζουν στο κοινό όσο το δυνατό μεγαλύτερο μέρος του υλικού της συλλογής του, που βρίσκεται στους αποθηκευτικούς χώρους, ενώ συγχρόνως αποτελούν πρώτης τάξεως ευκαιρία για έρευνα και εμπλουτισμό της συλλογής με νέα αντικείμενα και φωτογραφίες.